Escovar os dentes duas ou três vezes por dia, depois das refeições, durante dois ou três minutos. Após um uso prolongado de produtos que contêm clorexidina e ao contacto com certas substâncias como o chá, café, vinho ou tabaco pode aparecer uma certa coloração amarelada sobre a superfície dental e chumbos. Dita coloração não é permanente e pode ser eliminada com uma profilaxia na clínica odontológica. Pode aparecer uma alteração transitória do paladar com tratamentos mais prolongados. Está contra-indicado em pacientes que tenham demonstrado uma reação de hipersensibilidade à clorexidina. Estas reações são extremamente raras.